Konrad Gorzelańczyk
Kraj: Poland
Lokalizacja: Poznań, PL
Na Useme od 25 czerwca 2025
O mnie
Jestem studentem 4. semestru Inżynierii Bioinformatycznej na Politechnice Poznańskiej. Prowadzę odtwarzalne badania dynamiki molekularnej (MD) w GROMACS (TIP4P, NVT/NPT) na klastrach HPC i prezentowałem wyniki prof. J. Błażewiczowi. Piszę produkcyjny kod w C++17 (ponad 3 lata, algorytm genetyczny do składania DNA z adaptacyjnym krzyżowaniem/mutacją, Google Test, CMake) i Pythonie (NumPy, SciPy, pandas, MDAnalysis) oraz R/Bioconductor (analizy różnicowej ekspresji, 3D-QSAR). Automatyzuję workflowy od PackMol po analizy trajektorii (RDF, MSD, powierzchnie energii), pracując na Linuxie, Slurmie i GPU. Koordynuję studencką sekcję Computer-Aided Drug Design, łącząc ML, MM, grafowe sieci neuronowe i metadynamikę. Mam kilka krajowych stypendiów za wyniki akademickie i popularyzację STEM. Kładę nacisk na dokumentację, czysty, testowany kod i powtarzalne, wydajne przepływy pracy. Dostarczam wyniki na wysokim poziomie, informując interesariuszy na każdym etapie.
CV / Résumé
Lut 2021 - Kwi 2021
Programista stażysta
InfoBemar
Samodzielne tworzenie aplikacji z zastosowaniem metaheurystyk – aplikacja do zarządzania systemem wind w C++.
Portfolio
Modułowa platforma R do analizy danych medycznych z automatycznym testowaniem statystycznym, wizualizacją i raportami HTML.
Konteneryzowany, skalowalny workflow RNA-Seq w Nextflow: QC (FastQC/MultiQC), alignacja (STAR/HISAT2), kwantyfikacja (Salmon/featureCounts), analiza różnicowej ekspresji (DESeq2), obsługa Docker/Singularity, CI/CD GitHub Actions.
Projekt jest zaawansowaną aplikacją przeznaczoną do składania sekwencji DNA przy użyciu metaheurystyki, w szczególności algorytmów genetycznych. Został zaimplementowany w języku C++17 i kładzie nacisk na optymalizację kombinatoryczną.
Akademicki projekt C++17: symulacja dynamiki molekularnej 2D z potencjałem Lennarda-Jonesa, obliczeniami all-pairs i zapisem danych do analizy. Wzorce Factory/Builder, wizualizacja Pygame; planowany rozwój do modelu 3D wody z solutami.